一、“三證合一”的過渡期問題？
答：2015年10月1日至2017年12月31日為過渡期，原營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證仍可繼續使用。在辦理企業類市場主體變更登記時，換發“一照一碼”執照，原營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證由企業登記機關收繳、存檔。
從2018年1月1日起，一律改為使用加載統一社會信用代碼的營業執照，原發證照不再有效。
二、實行“三證合一、一照一碼”后如何辦理變更登記？
答：生產經營地、財務負責人、核算方式由企業登記機關在新設時采集，在稅務管理過程中，上述信息發生變化的，由企業向主管稅務機關，即各區國、地稅局申請變更。
除上述三項信息外，企業在登記機關新設時采集的信息發生變更，均由企業向登記機關申請變更。
2015年10月1日之前的已登記企業（包括已試點“一照三號”，“一照一號”登記制度改革的自貿區企業），在市市場監督管理局辦理變更登記或申請換照時，應向其交回原發的營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證；沒有領取組織機構代碼證和稅務登記證的，應提交未辦理組織機構代碼證和稅務登記證的申明。
三、“三證合一”后需要去稅務局辦理什么事項？
答：企業換發“一照一碼”營業執照后，原發營業執照、組織機構代碼證和稅務登記證自然失效，企業原來使用的納稅人識別號，也換成18位的統一社會信用代碼，因納稅人識別號的變更，納稅人需到稅務局辦理相關的后續事宜，如重新簽訂“稅庫銀三方協議”、防偽稅控系統報稅、清卡、退票及重新發行等。
有關稅控系統的操作，建議納稅人登陸我局網站“首頁-廈門國稅12366-新政專題輔導”板塊，查看“三證合一”變更為統一社會信用代碼的納稅人辦稅注意事項》中相關內容。
四、“三證合一”后 ，需要重新刻制發票專用章嗎？
答：取得18位統一社會信用代碼后，原15位納稅人代碼的發票專用章不可繼續使用，重新刻制。
五、“三證合一”后，稅控系統變更前開具的藍字發票需要沖紅，如何處理？
答：1、普通發票：直接在稅控系統中紅沖，系統會提示無法找到相應藍字發票，可以選擇手工錄入填寫；2、專用發票：在稅控系統中填寫信息表，打印出來后提交到主管稅務機關柜臺審核，通過后開紅字。
六、出口企業“三證合一”后，稅號變更為18位，需要辦理退稅資格變更嗎？
答：對于出口退稅審核系統納稅人，在出口退稅備案中增加社會信用代碼，數據由征管系統自動導入，出口企業不用來退稅部門變更出口退稅認定。
七、企業變更為18位稅號后，VPN賬戶要如何處理？
答：在變更為統一社會信用代碼前，我局經辦人員會先查詢該納稅人是否有未驗舊的發票信息，如果全部為正常開具發票，會幫納稅人驗舊，然后變更為統一社會信用代碼；如果有作廢或紅沖票，我局經辦人員會通知納稅人到柜臺驗舊，驗舊后才能變更統一社會信用代碼。
八、企業變更18位稅號后，是否需要換新的發票簿？
答：不需要，使用原發票簿就可。
九、“三證合一”后，有遺漏認證或者發票開具出錯的如何處理？
答：由于之前有保留舊檔案，開具發票有誤的可以用18位開具紅字發票，企業若變更新稅號后還有舊稅號的進項票需認證，則要求進項發票退回銷方，重新取得新稅號的進項發票。
十、“三證合一”后，企業變更18位稅號，獲得的海關繳款憑證是否可以上傳比對？
答：可以，在通用數據采集軟件中重新載入18位統一社會信用代碼后采集信息上傳。